Первый космический полет Геннадий Михайлович совершил 1 августа 1990 года  в качестве командира 7-й основной экспедиции на орбитальный комплекс "Мир".  Во время полёта выполнил обширную программу, в ходе которой были получены новые результаты исследований в интересах фундаментальных наук и практического использования в различных областях народного хозяйства.  29 октября  совершил выход в открытый космос продолжительностью 2 часа 45 минут.

      С 24 января по 22 июля 1993 года совершил свой второй космический полет в качестве командира ТК «Союз ТМ-16» и орбитального комплекса «Мир». Во время полета совершил два выхода в открытый космос. Продолжительность полета составила 179 суток.

      Руководство Центра подготовки космонавтов имени Ю. А. Гагарина,  лётчики-космонавты, весь коллектив ЦПК сердечно поздравляют Героя Советского Союза, летчика-космонавта СССР Геннадия Михайловича Манакова  с Днем рождения и желают крепкого здоровья, благополучия, счастья, оптимизма, успехов в профессиональной деятельности и новых свершений!