Первый космический полет Юрий Михайлович совершил 13 августа 1998 года в качестве космонавта-исследователя транспортного корабля «Союз ТМ-28» и орбитального комплекса «Мир» вместе с Геннадием Падалкой и Сергеем Авдеевым по программе экспедиции посещения.

Во второй раз Юрий Михайлович полетел в космос 28 апреля 2001 года в качестве бортинженера транспортного корабля «Союз ТМ-32» и бортинженера первой российской экспедиции посещения МКС. Продолжительность полета составила 7 суток 22 часа.

Руководство Центра подготовки космонавтов имени Ю. А. Гагарина, летчики-космонавты, весь коллектив ЦПК сердечно поздравляют Героя России, летчика-космонавта РФ Юрия Михайловича Батурина с Днем Рождения и желают ему крепкого здоровья, успехов в профессиональной деятельности и новых свершений.